目前，我国民办高校因多方原因，在党建工作上仍存在不少问题，如民办高校普遍实行的是董事会领导下的校长负责制，与公办高校党委领导下的校长负责制不同，党组织不处于领导地位，无权决定学校的重大问题，难以实现“党管干部”的原则，党组织作用不明确。同时，民办高校教师流动性较大，党员队伍不稳定，党员管理难度较大。而且上级党组织对民办高校党组织建设的支持、指导和交流不够，民办高校中开展组织活动、参加学习、发展新党员等方面与公办高校仍有一定差距。还有党组织机构设置不合理、缺乏必要的条件保障等问题。

面对诸多“内忧外患”，如何加强民办高校党的建设变得尤为重要且亟待解决。

从学校自身角度，首先，要提高认识，重视党建工作。牢固树立和自觉践行政治意识、大局意识、核心意识、看齐意识。其次，充分发挥党组织参与重大问题决策的作用。要发挥党组织的政治核心作用，必须要在董事会领导下的校长负责制这一特殊组织框架内构建合适的参与途径，如党组织主要负责人进入学校董事会,直接参与学校的决策和管理等。再次，建立和完善党建相关工作制度。尽快制订加强党建工作的相关规章制度，同时要强化制度落实，进一步规范民办高校党建工作。最后，加强党员队伍的教育和学习，提高党员队伍的能力素质。做好在高校教师和学生中发展党员工作，使每个师生党员都做到在党爱党、在党言党、在党为党。

从管理机关的角度，上级党组织应给予民办高校支持，对党组织建设工作定期检查、指导党建工作、交流党建经验等，在顶层设计、规划发展等方面提供强有力的支持。教育主管部门应完善党建工作考评体系，完善奖惩机制，对党建工作开展有力的学校、党组织给予表彰和奖励。